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大话Alphafold与医药人类是否掌握 [复制链接]

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接近「神的代码」的Alphafold

前不久,有关Alphafold的新闻震惊了整个科研界,

Google旗下的人工智能公司Deepmind研发的AI系统Alphafold2预测了98.5%的人类蛋白质结构,

其预测的氨基酸样本中,58%达到可信水平,其中35.7%达到高置信度。

「依我之见,这是人工智能对科学领域最大的一次贡献,也是人类在21世纪取得的最重要的科学突破之一。」生物物理学家、西湖大学校长施一公对此给出极高评价。

光看数字有点抽象,那这背后究竟意味着怎样的成就?为什么又引起了部分关于「AI终结人类文明」的恐慌言论?

先得说说相关概念,

蛋白质是组成人体一切细胞、组织的重要成分,属于有机大分子,是构成细胞的基本有机物,是生命活动的主要承担者,没有蛋白质就没有生命。氨基酸是蛋白质的基本组成单位。它是与生命及与各种形式的生命活动紧密联系在一起的物质。机体中的每一个细胞和所有重要组成部分都有蛋白质参与。

简单来说,蛋白质的结构就是人体的「创世密码」,破解了蛋白质的奥秘,那么一切生长、疾病、衰老、甚至死亡的奥秘,也都将慢慢破解。

如果把人体比作电脑来解释会更加形象:我们会用word、PPT、excel等办公软件,但当软件或者电脑系统出问题时,我们可能会有一些类似「重启」、「调整设置」的办法,但是并不知道其原理是什么,

而破解了蛋白质的结构,就等同于掌握了电脑的开发代码,我们可以使用代码开发或修改任何软件本身,从而使之成为我们「最满意的模样」。

因此,Alphafold的成果,无异于离「掌握神的创世代码」又近了一步。

神创造了这个世界以及人类,

而人类创造了人工智能以及虚拟世界,

相比真实世界,虚拟世界还显得有些粗糙,但已在逐步接近,

借鉴参考虚拟的世界,从而揭开真实世界的奥秘并非不可能,

因此,人工智能,可能就是人类一步步接近「神」的钥匙。

不再神秘的「砖块」和「设计图」

前面说的有点玄幻,

瞻仰了「星空宇宙」,最终还是要脚踏实地。

那么蛋白质结构的预测为什么听起来无比重要?它能在不久的将来给我们带来哪些想象空间?

我们首先用砖头来举个例子,

众所周知,砖头通过各种排列组合,可以堆积成功能体,

房屋、路面、灶台……

房屋用来遮风挡雨、路面用来通行、灶台用来生火做饭……

这些组合成的工事单位,就可以看作成蛋白质,

「Y」型的蛋白质构成了我们的免疫系统、「绳子」形状的蛋白质构成了胶原蛋白……就好比生活中的房屋、公路等,以特定的形态出现,同时具备对应的功能,

而组成蛋白质的砖块,就叫做氨基酸,氨基酸通过一定的顺序脱水缩合成多肽,而这些多肽组成了一个个生物大分子,即蛋白质。

就好比一块块砖经过烧制成了大块的「石板」,工人再用这些石板砌成了房屋,铺成了路面,

而砖块也分为红砖、青砖、水泥等材质,有的坚硬、有的耐磨、有的防水……

这种属性,放在氨基酸中,就是基因。氨基酸中带有了各类型的基因片段,就成了拥有不同属性的「砖块」,从而组合在一起,成为了拥有不同功能的蛋白质。

所以,人类如果想了解生物的奥秘,在人体中修补或搭建「更恢弘的建筑」、铺设「更广阔的公路」,首先就需要了解一个个「砖块」,

只不过,现实中的建筑设计图:每种砖有什么样的特色,砖块之间应如何叠放,遵照什么样的力学原理,这些对人类而言已近乎透明。

而各种蛋白质,无论是有免疫功能的「Y」型,胶原蛋白的「横线型」等,其内部真容对人类来说一直都还是个谜,投入了大量的精力物力,人类依然未能拿到完整的「设计图」,

直到Alphafold的横空出世:

以前的数十年间,科学家们持续不断的研究,只解密了人类蛋白质序列中17%的氨基酸残基,

而Alpha的强力出击,把这个数字骤然拉到了98.5%!

并且除了人类蛋白质组,Alphafold2还预测了包括大肠杆菌、果蝇、小鼠等20个具有科研常用生物的蛋白质组数据,总计超过35万个蛋白质的结构。

神秘的「设计图」,也终于逐渐揭开了其迷雾般的面纱,「蛋白质城堡」的「砖块结构」,也全方位地向人类展开。

相信在不远的未来,在Alpha们的帮助下,人们将以不再是秘密的「生物砖块」,去破解基因的奥秘,并完善和打造完美的「城堡」,

那时候,疾病、衰老、颜值缺陷……可能都不再是问题了吧。

药物研发的高效推手

蛋白质是整个生命活动的基本原件,蛋白质结构则是原件的基础。蛋白质是很多药物的靶点,因此很多药物的研发也蛋白质结构为基础。

举个例子,一个房屋出现了漏雨问题,工人需要对其进行修补,那么首先需要确认的是哪块砖出现了问题,从而在哪里补漆。

同样,一个人生了病,假如治疗药物就是那个「油漆」,而油漆作用在哪块「砖」上,就是药物作用在蛋白质的某个「部位」上。

过去,药物科学家往往能大概判定有一个「新油漆」,对房屋的漏水可能会有很好的修补效果,

但是这个油漆刷在房屋的哪块砖,或哪些缝隙中,会有最好的效果,还需要一点点去实验,去试错,花费大量的成本投入,因为过去这个房屋的「结构设计图」对人类是未知的,

因此,弄清楚蛋白质的结构,对药物的研发工作至关重要。

而伴随着AlphaFold2破译了98.5%的人类蛋白质组结构,并将数据免费通过公共数据库(由欧洲生物信息学研究所托管)面向全人类共享,全世界的药物研发都将在未来因此获利。

除了对靶点的定位,人工智能在整个药物研发环节,都可以起到重大作用:

药物发现、临床前研究、毒理实验、动物实验、人体临床试验、新药审批等……德勤分析报告显示,现阶段新药研发的平均耗时超过10年,耗资10亿美金以上,使制药业成为了世界上成本最贵、风险最高的行业之一。

而诸如Alphafold等人工智能强大的自主学习能力以及比人脑高了无数倍的计算效率,可以协助药物研发人员让药物研发事半功倍,甚至将效率和成功率提高数倍,这也将吸引更多有志之士,投身到药物研发的行业中来,为人类的健康事业做出巨大贡献。

此外,一些在过去因为「经济价值」不被看好而放弃研究的药物领域,如白化病、成骨不全症、大疱性表皮松懈症等罕见病,由于回报率低、患者多为贫困人口等原因,导致没有公司在这些方向投入,从而没有什么特效药物,患者也因此痛苦不堪,人工智能的发展,将这些药物研发成本降低,相对抬高了对应的「经济价值」,也可能将是一些罕见病患者的福音。

而针对一些突发性疾病,好比突如其来的新冠肺炎,AI也可以有效帮助研究者们快速解析病毒的蛋白结构,加速药物和疫苗的研发。

人工智能对于医药,对于人类健康的推进作用,不容小觑。

纷纷入局的国内外参与者

Deepmind的Alphafold走在了世界的前列,

但除其以外,国内外其实有不少公司都走在了「AI+」的道路上,

从全球范围来看,有老牌的制药公司,如阿斯利康、强生、默沙东,赛诺菲、葛兰素史克、辉瑞等,选择与一些新兴的人工智能公司展开合作,借助AI提高药物研发效率;

有致力于开发AI自动化药物的研发指导平台的公司Exscientia,有主攻从海量药物研发数据和知识中提取有用信息AI技术的BenevolentAI,有运用AI预测新药效果的公司Atomwise,有主要用AI分析基因突变对蛋白功能和表达的影响的公司DeepGenomics等。

而国内也同样不乏参与者,作为CRO龙头药企的药明康德,早已开始在AI领域进行布局,先后投资了多家国外的人工智能公司。此外,剂泰医药是国内AI医药领域的「先锋兵」,也是全球首家以AI驱动的药物制剂开发初创公司:制剂一直是制药中的一个重要环节,剂型的正确选择、制剂的成形能否成功,直接关系到一个药物化学式能否最终转化成一个可供服用的产品。

而中国,一直是制剂的弱国,尤其是「高端制剂」方面,相比上世纪八九十年代就开始重点发展的欧美国家,中国的高端制剂即使在这几年,也还处于相对空白的状态,国内开发的药品,仍以片剂、胶囊、冲剂等传统剂型为主,而在国际舞台上已大展拳脚的透皮制剂、长效微球制剂、缓控释制剂等在某个角度有着独到优势的「高端剂型」,一直是国内制药界的痛点。

一是缺乏技术与经验,二是需要大量的实验数据及推断时间。

而人工智能的高推算力及大数据存储等优势,可助力国内制药企业在制剂领域更快地赶上欧美、与国际接轨。

无论国内还是国外,巨头企业还是创业公司,人工智能技术的发展与成功都需要科学工作者「工匠般的专注、持久战的觉悟、失败后的再战」的执着付出,同时也需要外界资本的坚持投入和耐心等待,这是一个划时代的革命技术,绝非一朝一夕之功,盲目追求「功利」与「速度」,必将导致失败。

是「黎明之光」还是「潘多拉魔盒」

如果说,人是由「神」创造的,

那么创造了拥有自主学习能力的人工智能,

无疑是专属于人类的一次「造物」,

而人工智能,就是「仿神」的手段,

用「仿神」的手段去探测「神」创造的世界,

无疑是揭开造物之谜,看见黎明之光的绝佳方式。

然而,

也有人说人工智能是潘多拉的魔盒。

在日内瓦举办的联合国武器公约会议上,一款杀手机器人被曝光:

「这个杀手机器人,其实是一架体型很小的智能无人机,跟蜜蜂一样大,但处理器比人类快倍,可以躲避人类各种追踪。

它全身装备了黑科技装备:广角摄像头、传感器、面部识别,应有尽有。只要把目标图像信息输入它身上,它就能手术刀般精准找到打击对象,戴口罩、伪装统统没用,它的识别率高达99.99。

每个杀手机器人配有3克浓缩炸药,确定目标后,一次撞击可以毫无压力爆头,摧毁整个大脑。而且还能穿透建筑物、汽车、火车,躲避人类子弹,应对几乎所有防御手段。

如果把一个造价仅万美元的杀人机器蜂群释放出去,就可以杀死半个城市的人。如果有科学家在代码里面加一行毁灭人类的指令,或者人工智能突然变异成反人类的品种,整个人类或将被机器人的基因武器横扫,甚至灭亡。」

霍金提到过,「人工智能是人类真正的终结者,彻底开发人工智能可能导致人类灭亡。」

也有人用人工智能来比喻这次全球性的灾难——Covid-19/p>

「从能得到的公开信息来看,新冠病毒并不像是一个自然产生的病毒,它所具备的许多特性让它更像是一个极微小(纳米)的智能机器人,可以自由自在地在人体的细胞内穿梭巡游,人类的肺脏、肝脏、肾脏、大脑、免疫系统、排泄系统、生殖系统,统统都是它的攻击目标。而在发起攻击的同时,它还可以轻松躲过药物对它的追杀,直到和宿主一起同归于尽。」

……听起来确实有些毛骨悚然。

然而,

究竟是「掌握了神的创世代码进而造福人类」,还是「打开了潘多拉的魔盒放出了灾难」,这一切应当取决于人类本身,

手术刀可以济世救人,刺刀也可以成为杀戮的兵器,

只有使用工具的好人与坏人,而没有「好工具」或「坏工具」,

至少,在解析蛋白质结构,在医药研发的助力上,

人工智能更多地让人们看到了黎明的曙光。

图源网络,侵删

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